Les films d'action vont et viennent, mais le chef-d'œuvre phare des Wachowski de 1999 perdure. « The Matrix » reste non seulement le meilleur opus de sa trilogie respective, mais aussi un exploit déterminant du cinéma d'action de science-fiction. Le film était si frais et inattendu lors de sa sortie au tournant du millénaire qu'il semblait presque transcender le médium de l'action réelle.
Il y a aussi une raison à cela. Il s'avère que « The Matrix » a été fortement influencé par trois films d'animation classiques : le légendaire cyberpunk « Akira » de Katsuhiro Otomo de 1988, la pièce surnaturelle de la période Edo de Yoshiaki Kawajiri « Ninja Scroll » et l'œuvre futuriste de Mamoru Oshii de 1995 « Ghost in the Shell », cette dernière basée sur le manga du même nom de Masamune Shirow.
Dans une interview sur le site Web de Warner Brothers (via Matrixfans), les Wachowski ont révélé que ces trois anime en particulier ont influencé leur film d'action de science-fiction phare, et ont également expliqué comment ils ont façonné « The Matrix ». « Dans l'anime, une chose que nous avons essayé d'apporter à notre film était une juxtaposition du temps et de l'espace dans des rythmes d'action », ont-ils déclaré.
Le créateur de Ninja Scroll a ensuite travaillé avec les Wachowski sur The Animatrix.
En plus d'admettre librement l'influence de « Akira », « Ghost in the Shell » et « Ninja Scroll », les Wachowski ont également mis leurs paroles en pratique. Le duo a fait appel au scénariste-réalisateur de « Ninja Scroll », Yoshiaki Kawajiri, pour travailler sur « The Animatrix », une anthologie animée de 2003 qui figure toujours dans la chronologie de « The Matrix ».
Kawajiri a écrit et réalisé « Program », un segment qui se concentre sur une simulation du Japon féodal dans lequel une femme nommée Cis (Hedy Burress en anglais, Kaho Kôda en japonais) rencontre un mystérieux samouraï appelé Duo (Phil LaMarr, Toshiyuki Morikawa), pour découvrir que la situation est bien plus compliquée qu'elle ne le pensait. De plus, Kawajiri a également écrit le segment « World Record », sur un coureur olympique dévoué (Victor Williams, Hiroki Tōchi) qui se libère temporairement de la Matrice grâce à sa seule volonté.
Dans une interview (via Matrixfans), Kawajiri a déclaré qu'il appréciait également « The Matrix » et a partagé son expérience de travail sur « The Animatrix ». « C'est un grand projet », a-t-il déclaré. « C'était très attirant pour moi parce que la seule limitation était que je devais jouer dans le monde de Matrix ; à part ça, j'ai pu travailler en toute liberté. Et comme c'est un programme assez court et un court métrage – six à dix minutes – c'est génial. »
